Tüp bebek laboratuvarlarında sperm ve yumurta hücrelerinin döllenmesiyle elde edilen embriyoların ileri bir tarihte kullanılmak üzere dondurulup saklanması işlemidir. Tedavi sırasında karşılaşılan ve tedavinin durdurulması/ertelenmesi gereken durumlarda da embriyo dondurulmaktadır. Tüp bebek ile ilgili yönetmelikte transfer edilecek embriyo sayısı kısıtlanmış olup varsa artan embriyolardan uygun olanlar eşlerden her ikisinin de rızası alınarak sıvı azot tanklarında dondurularak saklanır. Embriyolar 1. günden 6. güne kadar tüm gelişim evrelerinde dondurulabilmektedir. Dondurma işleminde embriyolar gelişim aşamasına özel bir teknikle ve koruyucu bir sıvı ile karıştırılarak tüplere konulur ve sıvı nitrojen (-196OC) içerisinde dondurularak tanklarda saklanır.
Saklama süresinin 1 yılı geçmesi halinde, çiftlerin tekrar başvuruda bulunup saklanma süresinin uzatılmasının istendiğine dair imzalı dilekçe vermesi gerekmektedir. Gerektiğinde dondurulmuş olan bu embriyolar daha sonraki tüp bebek uygulamaları için çözdürülerek kullanılabilir. Böylece anne adayının sonraki tüp bebek uygulamalarında kolaylık sağlanmakta ve maliyet azaltılmaktadır.